При разработке модуля для Bitrix, правильное подключение JavaScript файла и его размещение для вывода на всех страницах сайта нужно выполнить следующим образом:
1. Создайте файл с расширением .js, содержащий ваш скрипт.
2. Поместите данный файл в директорию вашего модуля. Обычно это директория "bitrix/modules/название_вашего_модуля/install/js".
3. Создайте файл с расширением .php, который будет отвечать за подключение JavaScript файла к страницам сайта. Этот файл следует разместить в директории "bitrix/modules/название_вашего_модуля/install/js" вместе с JavaScript файлом. Назовем данный файл "include.php".
4. В файле "include.php" добавьте следующий код:
<?php
CJSCore::RegisterExt('название_вашего_модуля', array(
'js' => '/bitrix/js/название_вашего_модуля/название_вашего_скрипта.js',
));
CJSCore::Init(array('название_вашего_модуля'));
?>
В данном коде "название_вашего_модуля" - это уникальное название вашего модуля, которое вы задаете при его создании, а "название_вашего_скрипта" - это имя вашего JavaScript файла без расширения.
5. Далее необходимо зарегистрировать файл "include.php" в файле "bitrix/php_interface/init.php", чтобы он гарантированно подключался на всех страницах сайта. Для этого добавьте следующий код:
<?php
if (file_exists($_SERVER["DOCUMENT_ROOT"]."/bitrix/modules/название_вашего_модуля/install/js/include.php"))
require_once($_SERVER["DOCUMENT_ROOT"]."/bitrix/modules/название_вашего_модуля/install/js/include.php");
?>
После выполнения этих действий, ваш JavaScript файл будет успешно подключен и будет доступен на всех страницах сайта, что позволит вам использовать его функционал внутри вашего модуля для Bitrix.
Не забудьте также добавить необходимые проверки на существование файла и модуля, а также правильно оформить загрузку своего модуля и передачу файлов на Production-сервер.