В Symfony, при выполнении команды bin/console, фреймворк будет искать файл console в корневом каталоге проекта. Файл console является входной точкой для запуска консольных команд Symfony.
Если вы создали еще одну директорию вручную и скопировали в нее файл console, тогда Symfony будет использовать этот файл вместо оригинального. В этом случае, при выполнении команды bin/console, Symfony будет искать файл console в новой директории.
Таким образом, Symfony может использовать измененный файл console, если он был скопирован в другую директорию. Однако, важно убедиться, что новый console файл точно имеет все необходимые зависимости и конфигурацию, чтобы работать корректно с фреймворком Symfony. Иначе, команда bin/console может не работать как ожидается.